Paket: bwa (0.7.17-7 och andra)
Länkar för bwa
Debianresurser:
Hämta källkodspaketet bwa:
Ansvariga:
- Debian Med Packaging Team (QA-sida, E-postarkiv)
- Charles Plessy (QA-sida)
- Andreas Tille (QA-sida)
- Carlos Borroto (QA-sida)
- Ognyan Kulev (QA-sida)
- Michael R. Crusoe (QA-sida)
Externa resurser:
- Hemsida [bio-bwa.sourceforge.net]
Liknande paket:
Burrows-Wheeler Aligner
BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.
Andra paket besläktade med bwa
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Kompressionsbibliotek - körtidspaket
-
- rec: perl
- Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
-
- sug: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
Hämta bwa
Arkitektur | Version | Paketstorlek | Installerad storlek | Filer |
---|---|---|---|---|
alpha (inofficiell anpassning) | 0.7.17-7+b5 | 206,9 kbyte | 513,0 kbyte | [filförteckning] |
amd64 | 0.7.17-7+b3 | 207,3 kbyte | 453,0 kbyte | [filförteckning] |
arm64 | 0.7.17-7+b3 | 189,1 kbyte | 449,0 kbyte | [filförteckning] |
armel | 0.7.17-7+b3 | 190,8 kbyte | 432,0 kbyte | [filförteckning] |
armhf | 0.7.17-7+b3 | 190,0 kbyte | 320,0 kbyte | [filförteckning] |
hppa (inofficiell anpassning) | 0.7.17-7+b3 | 226,4 kbyte | 513,0 kbyte | [filförteckning] |
i386 | 0.7.17-7+b3 | 230,1 kbyte | 520,0 kbyte | [filförteckning] |
ia64 (inofficiell anpassning) | 0.7.17-7+b4 | 280,4 kbyte | 925,0 kbyte | [filförteckning] |
m68k (inofficiell anpassning) | 0.7.17-7+b3 | 204,7 kbyte | 472,0 kbyte | [filförteckning] |
mips64el | 0.7.17-7+b3 | 201,0 kbyte | 528,0 kbyte | [filförteckning] |
ppc64 (inofficiell anpassning) | 0.7.17-7+b3 | 218,1 kbyte | 577,0 kbyte | [filförteckning] |
ppc64el | 0.7.17-7+b3 | 228,6 kbyte | 577,0 kbyte | [filförteckning] |
riscv64 | 0.7.17-7+b3 | 214,5 kbyte | 376,0 kbyte | [filförteckning] |
s390x | 0.7.17-7+b3 | 220,3 kbyte | 509,0 kbyte | [filförteckning] |
sh4 (inofficiell anpassning) | 0.7.17-7+b3 | 273,6 kbyte | 449,0 kbyte | [filförteckning] |
sparc64 (inofficiell anpassning) | 0.7.17-7+b3 | 182,7 kbyte | 1.093,0 kbyte | [filförteckning] |
x32 (inofficiell anpassning) | 0.7.17-7+b3 | 218,9 kbyte | 468,0 kbyte | [filförteckning] |