Пакунок: bwa (0.7.17-7 and others)
Links for bwa
Debian Resources:
Download Source Package bwa:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Charles Plessy (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Carlos Borroto (QA Page)
- Ognyan Kulev (QA Page)
- Michael R. Crusoe (QA Page)
External Resources:
- Homepage [bio-bwa.sourceforge.net]
Similar packages:
Burrows-Wheeler Aligner
BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.
Інші пакунки пов'язані з bwa
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)
-
- rec: perl
- Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)
-
- sug: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
Завантажити bwa
Архітектура | Версія | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
---|---|---|---|---|
alpha (unofficial port) | 0.7.17-7+b5 | 206.9 kB | 513.0 kB | [список файлів] |
amd64 | 0.7.17-7+b3 | 207.3 kB | 453.0 kB | [список файлів] |
arm64 | 0.7.17-7+b3 | 189.1 kB | 449.0 kB | [список файлів] |
armel | 0.7.17-7+b3 | 190.8 kB | 432.0 kB | [список файлів] |
armhf | 0.7.17-7+b3 | 190.0 kB | 320.0 kB | [список файлів] |
hppa (unofficial port) | 0.7.17-7+b3 | 226.4 kB | 513.0 kB | [список файлів] |
i386 | 0.7.17-7+b3 | 230.1 kB | 520.0 kB | [список файлів] |
ia64 (unofficial port) | 0.7.17-7+b4 | 280.4 kB | 925.0 kB | [список файлів] |
m68k (unofficial port) | 0.7.17-7+b3 | 204.7 kB | 472.0 kB | [список файлів] |
mips64el | 0.7.17-7+b3 | 201.0 kB | 528.0 kB | [список файлів] |
ppc64 (unofficial port) | 0.7.17-7+b3 | 218.1 kB | 577.0 kB | [список файлів] |
ppc64el | 0.7.17-7+b3 | 228.6 kB | 577.0 kB | [список файлів] |
riscv64 | 0.7.17-7+b3 | 214.5 kB | 376.0 kB | [список файлів] |
s390x | 0.7.17-7+b3 | 220.3 kB | 509.0 kB | [список файлів] |
sh4 (unofficial port) | 0.7.17-7+b3 | 273.6 kB | 449.0 kB | [список файлів] |
sparc64 (unofficial port) | 0.7.17-7+b3 | 182.7 kB | 1,093.0 kB | [список файлів] |
x32 (unofficial port) | 0.7.17-7+b3 | 218.9 kB | 468.0 kB | [список файлів] |