Paket: bwa (0.7.18-1 ve diğerleri)

[ Kaynak: bwa  ]

Burrows-Wheeler Aligner

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

Etiketler: Biyoloji: Proteinler, Alan: Biyoloji, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, Kullanıcı Arayüzü: Komut Satırı, interface::text-mode, role::program, Amaç: Analiz, Karşılaştırma

bwa ile İlgili Diğer Paketler

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 değil]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4 değil]

  compression library - runtime

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

• rec: perl

  Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

bwa indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	0.7.18-1	211,7 kB	512,0 kB	[dosya listesi]
amd64	0.7.18-1	206,9 kB	459,0 kB	[dosya listesi]
arm64	0.7.18-1	193,6 kB	447,0 kB	[dosya listesi]
armel	0.7.18-1	194,1 kB	438,0 kB	[dosya listesi]
armhf	0.7.18-1	193,3 kB	326,0 kB	[dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port)	0.7.18-1	226,8 kB	511,0 kB	[dosya listesi]
i386	0.7.18-1	231,1 kB	522,0 kB	[dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port)	0.7.17-7+b4	280,4 kB	925,0 kB	[dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port)	0.7.18-1	205,3 kB	470,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	0.7.18-1	204,7 kB	526,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	0.7.18-1	219,7 kB	575,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	0.7.18-1	230,2 kB	575,0 kB	[dosya listesi]
riscv64	0.7.18-1	214,6 kB	375,0 kB	[dosya listesi]
s390x	0.7.18-1	222,8 kB	511,0 kB	[dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port)	0.7.18-1	276,1 kB	447,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	0.7.18-1	185,3 kB	1.091,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	0.7.18-1	217,6 kB	474,0 kB	[dosya listesi]