Paket: bwa (0.7.17-7 ve diğerleri)

[ Kaynak: bwa  ]

Burrows-Wheeler Aligner

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

Etiketler: Biyoloji: Proteinler, Alan: Biyoloji, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, Kullanıcı Arayüzü: Komut Satırı, interface::text-mode, role::program, Amaç: Analiz, Karşılaştırma

bwa ile İlgili Diğer Paketler

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 değil]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  compression library - runtime

• rec: perl

  Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

bwa indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	0.7.17-7+b5	206,9 kB	513,0 kB	[dosya listesi]
amd64	0.7.17-7+b3	207,3 kB	453,0 kB	[dosya listesi]
arm64	0.7.17-7+b3	189,1 kB	449,0 kB	[dosya listesi]
armel	0.7.17-7+b3	190,8 kB	432,0 kB	[dosya listesi]
armhf	0.7.17-7+b3	190,0 kB	320,0 kB	[dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port)	0.7.17-7+b3	226,4 kB	513,0 kB	[dosya listesi]
i386	0.7.17-7+b3	230,1 kB	520,0 kB	[dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port)	0.7.17-7+b4	280,4 kB	925,0 kB	[dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port)	0.7.17-7+b3	204,7 kB	472,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	0.7.17-7+b3	201,0 kB	528,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	0.7.17-7+b3	218,1 kB	577,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	0.7.17-7+b3	228,6 kB	577,0 kB	[dosya listesi]
riscv64	0.7.17-7+b3	214,5 kB	376,0 kB	[dosya listesi]
s390x	0.7.17-7+b3	220,3 kB	509,0 kB	[dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port)	0.7.17-7+b3	273,6 kB	449,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	0.7.17-7+b3	182,7 kB	1.093,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	0.7.17-7+b3	218,9 kB	468,0 kB	[dosya listesi]