Пакет: bwa (0.7.17-7 и други)
Връзки за bwa
Ресурси за Debian:
- Доклади за грешки
- Developer Information
- Журнал на промените в Debian
- Авторски права
- Управление на кръпките в Debian
Изтегляне на пакет-източник bwa.
Отговорници:
- Debian Med Packaging Team (Страница за QA, Пощенски архив)
- Charles Plessy (Страница за QA)
- Andreas Tille (Страница за QA)
- Carlos Borroto (Страница за QA)
- Ognyan Kulev (Страница за QA)
- Michael R. Crusoe (Страница за QA)
Външни препратки:
- Начална страница [bio-bwa.sourceforge.net]
Подобни пакети:
Burrows-Wheeler Aligner
BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.
Други пакети, свързани с bwa
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- compression library - runtime
-
- rec: perl
- Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
-
- sug: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
Изтегляне на bwa
Архитектура | Версия | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
---|---|---|---|---|
alpha (неофициална архитектура) | 0.7.17-7+b5 | 206,9 кБ | 513,0 кБ | [списък на файловете] |
amd64 | 0.7.17-7+b3 | 207,3 кБ | 453,0 кБ | [списък на файловете] |
arm64 | 0.7.17-7+b3 | 189,1 кБ | 449,0 кБ | [списък на файловете] |
armel | 0.7.17-7+b3 | 190,8 кБ | 432,0 кБ | [списък на файловете] |
armhf | 0.7.17-7+b3 | 190,0 кБ | 320,0 кБ | [списък на файловете] |
hppa (неофициална архитектура) | 0.7.17-7+b3 | 226,4 кБ | 513,0 кБ | [списък на файловете] |
i386 | 0.7.17-7+b3 | 230,1 кБ | 520,0 кБ | [списък на файловете] |
ia64 (неофициална архитектура) | 0.7.17-7+b4 | 280,4 кБ | 925,0 кБ | [списък на файловете] |
m68k (неофициална архитектура) | 0.7.17-7+b3 | 204,7 кБ | 472,0 кБ | [списък на файловете] |
mips64el | 0.7.17-7+b3 | 201,0 кБ | 528,0 кБ | [списък на файловете] |
ppc64 (неофициална архитектура) | 0.7.17-7+b3 | 218,1 кБ | 577,0 кБ | [списък на файловете] |
ppc64el | 0.7.17-7+b3 | 228,6 кБ | 577,0 кБ | [списък на файловете] |
riscv64 | 0.7.17-7+b3 | 214,5 кБ | 376,0 кБ | [списък на файловете] |
s390x | 0.7.17-7+b3 | 220,3 кБ | 509,0 кБ | [списък на файловете] |
sh4 (неофициална архитектура) | 0.7.17-7+b3 | 273,6 кБ | 449,0 кБ | [списък на файловете] |
sparc64 (неофициална архитектура) | 0.7.17-7+b3 | 182,7 кБ | 1 093,0 кБ | [списък на файловете] |
x32 (неофициална архитектура) | 0.7.17-7+b3 | 218,9 кБ | 468,0 кБ | [списък на файловете] |