パッケージ: bwa (0.7.18-1 など)

bwa に関するリンク

Debian の資源:

bwa ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [bio-bwa.sourceforge.net]

類似のパッケージ:

Burrows-Wheeler Aligner

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

タグ: 生物学: タンパク質, 分野: 生物学, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, ユーザインタフェース: コマンドライン, interface::text-mode, role::program, 目的: 解析, 比較

その他の bwa 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 以外]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4 以外]

圧縮ライブラリ - ランタイム

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

rec: perl

Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語

sug: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

bwa のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	0.7.18-1	211.7 kB	512.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	0.7.18-1	206.9 kB	459.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	0.7.18-1	193.6 kB	447.0 kB	[ファイル一覧]
armel	0.7.18-1	194.1 kB	438.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	0.7.18-1	193.3 kB	326.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	0.7.18-1	226.8 kB	511.0 kB	[ファイル一覧]
i386	0.7.18-1	231.1 kB	522.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	0.7.17-7+b4	280.4 kB	925.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	0.7.18-1	205.3 kB	470.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	0.7.18-1	204.7 kB	526.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	0.7.18-1	219.7 kB	575.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	0.7.18-1	230.2 kB	575.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	0.7.18-1	214.6 kB	375.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	0.7.18-1	222.8 kB	511.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	0.7.18-1	276.1 kB	447.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	0.7.18-1	185.3 kB	1,091.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	0.7.18-1	217.6 kB	474.0 kB	[ファイル一覧]