パッケージ: bwa (0.7.17-7 など)
bwa に関するリンク
Debian の資源:
bwa ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
- Debian Med Packaging Team (QA ページ, メールアーカイブ)
- Charles Plessy (QA ページ)
- Andreas Tille (QA ページ)
- Carlos Borroto (QA ページ)
- Ognyan Kulev (QA ページ)
- Michael R. Crusoe (QA ページ)
外部の資源:
- ホームページ [bio-bwa.sourceforge.net]
類似のパッケージ:
Burrows-Wheeler Aligner
BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.
その他の bwa 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 以外]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
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- rec: perl
- Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語
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- sug: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
bwa のダウンロード
アーキテクチャ | バージョン | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
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alpha (非公式の移植版) | 0.7.17-7+b5 | 206.9 kB | 513.0 kB | [ファイル一覧] |
amd64 | 0.7.17-7+b3 | 207.3 kB | 453.0 kB | [ファイル一覧] |
arm64 | 0.7.17-7+b3 | 189.1 kB | 449.0 kB | [ファイル一覧] |
armel | 0.7.17-7+b3 | 190.8 kB | 432.0 kB | [ファイル一覧] |
armhf | 0.7.17-7+b3 | 190.0 kB | 320.0 kB | [ファイル一覧] |
hppa (非公式の移植版) | 0.7.17-7+b3 | 226.4 kB | 513.0 kB | [ファイル一覧] |
i386 | 0.7.17-7+b3 | 230.1 kB | 520.0 kB | [ファイル一覧] |
ia64 (非公式の移植版) | 0.7.17-7+b4 | 280.4 kB | 925.0 kB | [ファイル一覧] |
m68k (非公式の移植版) | 0.7.17-7+b3 | 204.7 kB | 472.0 kB | [ファイル一覧] |
mips64el | 0.7.17-7+b3 | 201.0 kB | 528.0 kB | [ファイル一覧] |
ppc64 (非公式の移植版) | 0.7.17-7+b3 | 218.1 kB | 577.0 kB | [ファイル一覧] |
ppc64el | 0.7.17-7+b3 | 228.6 kB | 577.0 kB | [ファイル一覧] |
riscv64 | 0.7.17-7+b3 | 214.5 kB | 376.0 kB | [ファイル一覧] |
s390x | 0.7.17-7+b3 | 220.3 kB | 509.0 kB | [ファイル一覧] |
sh4 (非公式の移植版) | 0.7.17-7+b3 | 273.6 kB | 449.0 kB | [ファイル一覧] |
sparc64 (非公式の移植版) | 0.7.17-7+b3 | 182.7 kB | 1,093.0 kB | [ファイル一覧] |
x32 (非公式の移植版) | 0.7.17-7+b3 | 218.9 kB | 468.0 kB | [ファイル一覧] |