Pakiet: bwa (0.7.18-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: bwa  ]

Burrows-Wheeler Aligner

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

Znaczniki: Biologia: Białka, Dziedzina: Biologia, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, Interfejs użytkownika: Wiersz poleceń, interface::text-mode, role::program, Przeznaczenie: Analizowanie, Porównywanie

Inne pakiety związane z bwa

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nie armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

• rec: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

• sug: samtools

  Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

Pobieranie bwa

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	0.7.18-1	211,7 KiB	512,0 KiB	[lista plików]
amd64	0.7.18-1	206,9 KiB	459,0 KiB	[lista plików]
arm64	0.7.18-1	193,6 KiB	447,0 KiB	[lista plików]
armel	0.7.18-1	194,1 KiB	438,0 KiB	[lista plików]
armhf	0.7.18-1	193,3 KiB	326,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	0.7.18-1	226,8 KiB	511,0 KiB	[lista plików]
i386	0.7.18-1	231,1 KiB	522,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	0.7.17-7+b4	280,4 KiB	925,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	0.7.18-1	205,3 KiB	470,0 KiB	[lista plików]
mips64el	0.7.18-1	204,7 KiB	526,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	0.7.18-1	219,7 KiB	575,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	0.7.18-1	230,2 KiB	575,0 KiB	[lista plików]
riscv64	0.7.18-1	214,6 KiB	375,0 KiB	[lista plików]
s390x	0.7.18-1	222,8 KiB	511,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	0.7.18-1	276,1 KiB	447,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	0.7.18-1	185,3 KiB	1 091,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	0.7.18-1	217,6 KiB	474,0 KiB	[lista plików]