套件：bwa（0.7.18-1 以及其他的）

bwa 的相關連結

Debian 的資源：

下載原始碼套件 bwa：

維護小組：

外部的資源：

主頁 [bio-bwa.sourceforge.net]

相似套件：

Burrows-Wheeler Aligner

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

標籤: 生物學: 蛋白質, 領域: 生物學, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, 使用者介面: 命令行, interface::text-mode, role::program, Purpose: Analysing, Comparing

其他與 bwa 有關的套件

依賴

推薦

建議

增強

dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, loong64, sh4]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [除 armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

rec: perl

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

sug: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

下載 bwa

下載可用於所有硬體架構的
硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	0.7.18-1	211。7 kB	512。0 kB	[檔案列表]
amd64	0.7.18-1	206。9 kB	459。0 kB	[檔案列表]
arm64	0.7.18-1	193。6 kB	447。0 kB	[檔案列表]
armel	0.7.18-1	194。1 kB	438。0 kB	[檔案列表]
armhf	0.7.18-1	193。3 kB	326。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	0.7.18-1	226。8 kB	511。0 kB	[檔案列表]
i386	0.7.18-1	231。1 kB	522。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	0.7.17-7+b4	280。4 kB	925。0 kB	[檔案列表]
loong64 （非官方移植版）	0.7.18-1	214。7 kB	495。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	0.7.18-1	205。3 kB	470。0 kB	[檔案列表]
mips64el	0.7.18-1	204。7 kB	526。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	0.7.18-1	219。7 kB	575。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	0.7.18-1	230。2 kB	575。0 kB	[檔案列表]
riscv64	0.7.18-1	214。6 kB	375。0 kB	[檔案列表]
s390x	0.7.18-1	222。8 kB	511。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	0.7.18-1	276。1 kB	447。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	0.7.18-1	185。3 kB	1，091。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	0.7.18-1	217。6 kB	474。0 kB	[檔案列表]