Paket: bwa (0.7.17-8~0exp och andra)

[ Källkod: bwa  ]

Experimentellt paket

Varning: Paketet är från den experimentella utgåvan. Det innebär att det med stor sannolikhet är instabilt eller innehåller fel, och kanske till och med kan orsaka dataförluster. Se till att läsa ändringsloggen och annan dokumentation innan du använder det.

Burrows-Wheeler Aligner

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

Märken: Biologi: Proteiner, Field: Biologi, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, User Interface: Command Line, interface::text-mode, role::program, Purpose: Analysing, Comparing

Andra paket besläktade med bwa

• dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

• rec: perl

  Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Hämta bwa

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	0.7.17-8~0exp	222,1 kbyte	577,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	0.7.17-8~0exp	207,2 kbyte	452,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	0.7.17-8~0exp	188,8 kbyte	448,0 kbyte	[filförteckning]
armel	0.7.17-8~0exp	190,6 kbyte	431,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	0.7.17-8~0exp	190,1 kbyte	319,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	0.7.17-8~0exp	225,9 kbyte	512,0 kbyte	[filförteckning]
i386	0.7.17-8~0exp	231,7 kbyte	523,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	0.7.17-8~0exp	291,1 kbyte	962,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	0.7.17-8~0exp	203,9 kbyte	471,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	0.7.17-8~0exp	201,2 kbyte	527,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	0.7.17-8~0exp	216,9 kbyte	576,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	0.7.17-8~0exp	226,8 kbyte	576,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	0.7.17-8~0exp+b1	214,5 kbyte	376,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	0.7.17-8~0exp	190,3 kbyte	464,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	0.7.17-8~0exp	272,9 kbyte	448,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	0.7.17-8~0exp	182,5 kbyte	1.092,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	0.7.17-8~0exp	218,3 kbyte	471,0 kbyte	[filförteckning]