Pacote: bwa (0.7.18-1 e outros)

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Mantenedores(as):

Debian Med Packaging Team (QA Página, E-mail Arquivo)
Charles Plessy (QA Página)
Andreas Tille (QA Página)
Carlos Borroto (QA Página)
Ognyan Kulev (QA Página)
Michael R. Crusoe (QA Página)

Fontes externas:

Pagina principal [bio-bwa.sourceforge.net]

Pacotes similares:

Burrows-Wheeler Aligner

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

Etiquetas: Biologia: Proteínas, Campo: Biologia, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, Interface de usuário(a): Linha de comando, interface::text-mode, role::program, Propósito: Análise, Comparação

Outros pacotes relacionados a bwa

depende

recomenda

sugere

melhora

dep: libc6 (>= 2.34) [não alpha, ia64, loong64, sh4]

GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [não armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

rec: perl

Linguagem de extração e relatórios prática de Larry Wall

sug: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Download de bwa

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis
Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	0.7.18-1	211.7 kB	512.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	0.7.18-1	206.9 kB	459.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	0.7.18-1	193.6 kB	447.0 kB	[lista de arquivos]
armel	0.7.18-1	194.1 kB	438.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	0.7.18-1	193.3 kB	326.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	0.7.18-1	226.8 kB	511.0 kB	[lista de arquivos]
i386	0.7.18-1	231.1 kB	522.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	0.7.17-7+b4	280.4 kB	925.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	0.7.18-1	214.7 kB	495.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	0.7.18-1	205.3 kB	470.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	0.7.18-1	204.7 kB	526.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	0.7.18-1	219.7 kB	575.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	0.7.18-1	230.2 kB	575.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	0.7.18-1	214.6 kB	375.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	0.7.18-1	222.8 kB	511.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	0.7.18-1	276.1 kB	447.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	0.7.18-1	185.3 kB	1,091.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	0.7.18-1	217.6 kB	474.0 kB	[lista de arquivos]