Pacote: bwa (0.7.18-1)

[ Fonte: bwa  ]

Burrows-Wheeler Aligner

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

Etiquetas: Biologia: Proteínas, Campo: Biologia, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, Interface de usuário(a): Linha de comando, interface::text-mode, role::program, Propósito: Análise, Comparação

Outros pacotes relacionados a bwa

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [não armel, armhf]

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf]

• rec: perl

  Linguagem de extração e relatórios prática de Larry Wall

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Download de bwa

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	206.9 kB	459.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	193.6 kB	447.0 kB	[lista de arquivos]
armel	194.1 kB	438.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	193.3 kB	326.0 kB	[lista de arquivos]
i386	231.1 kB	522.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	204.7 kB	526.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	230.2 kB	575.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	214.6 kB	375.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	222.8 kB	511.0 kB	[lista de arquivos]