Pakiet: bwa (0.7.17-8~0exp i inne)

[ Pakiet źródłowy: bwa  ]

Pakiet eksperymentalny

Ostrzeżenie: Pakiet pochodzi z dystrybucji eksperymentalnej. Oznacza to, że prawdopodobnie jest niestabilny lub zawiera błędy i może spowodować nawet utratę danych. Przed użyciem pakietu proszę koniecznie zapoznać się z dziennikiem zmian i inną dostępną dokumentacją.

Burrows-Wheeler Aligner

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

Znaczniki: Biologia: Białka, Dziedzina: Biologia, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, Interfejs użytkownika: Wiersz poleceń, interface::text-mode, role::program, Przeznaczenie: Analizowanie, Porównywanie

Inne pakiety związane z bwa

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

• rec: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

• sug: samtools

  Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

Pobieranie bwa

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	0.7.17-8~0exp	222,1 KiB	577,0 KiB	[lista plików]
amd64	0.7.17-8~0exp	207,2 KiB	452,0 KiB	[lista plików]
arm64	0.7.17-8~0exp	188,8 KiB	448,0 KiB	[lista plików]
armel	0.7.17-8~0exp	190,6 KiB	431,0 KiB	[lista plików]
armhf	0.7.17-8~0exp	190,1 KiB	319,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	0.7.17-8~0exp	225,9 KiB	512,0 KiB	[lista plików]
i386	0.7.17-8~0exp	231,7 KiB	523,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	0.7.17-8~0exp	291,1 KiB	962,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	0.7.17-8~0exp	203,9 KiB	471,0 KiB	[lista plików]
mips64el	0.7.17-8~0exp	201,2 KiB	527,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	0.7.17-8~0exp	216,9 KiB	576,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	0.7.17-8~0exp	226,8 KiB	576,0 KiB	[lista plików]
riscv64	0.7.17-8~0exp+b1	214,5 KiB	376,0 KiB	[lista plików]
s390x	0.7.17-8~0exp	190,3 KiB	464,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	0.7.17-8~0exp	272,9 KiB	448,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	0.7.17-8~0exp	182,5 KiB	1 092,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	0.7.17-8~0exp	218,3 KiB	471,0 KiB	[lista plików]