Пакет: bwa (0.7.17-8~0exp) [debports]
Връзки за bwa
Ресурси за Debian:
Изтегляне на пакет-източник .
Няма съвпаденияОтговорници:
Външни препратки:
- Начална страница [bio-bwa.sourceforge.net]
Подобни пакети:
Експериментален пакет
Предупреждение: Този пакет е от дистрибуцията experimental. Това означава, че е възможно да е нестабилен или да има грешки, а може дори и да предизвика загуба на данни. Прочетете информация за промените и останалата документация преди да го използвате.
Burrows-Wheeler Aligner
BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.
Други пакети, свързани с bwa
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
-
- dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- compression library - runtime
-
- rec: perl
- Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
-
- sug: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
Изтегляне на bwa
Архитектура | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
---|---|---|---|
ia64 (неофициална архитектура) | 291,1 кБ | 962,0 кБ | [списък на файловете] |
riscv64 (неофициална архитектура) | 200,8 кБ | 345,0 кБ | [списък на файловете] |