套件：bwa（0.7.17-8~0exp 以及其他的）

[ 原始碼： bwa  ]

試製（Experimental）套件

警告：這個套件來自於 experimental 發行版。這表示它很有可能表現出不穩定或者出現 bug ，甚至是導致資料損失。請務必在使用之前查閱 changelog 以及其他潛在的文件。

Burrows-Wheeler Aligner

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

標籤: 生物學: 蛋白質, 領域: 生物學, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, 使用者介面: 命令行, interface::text-mode, role::program, Purpose: Analysing, Comparing

其他與 bwa 有關的套件

• dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, sh4]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)

• rec: perl

  Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

下載 bwa

下載可用於所有硬體架構的

硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	0.7.17-8~0exp	222。1 kB	577。0 kB	[檔案列表]
amd64	0.7.17-8~0exp	207。2 kB	452。0 kB	[檔案列表]
arm64	0.7.17-8~0exp	188。8 kB	448。0 kB	[檔案列表]
armel	0.7.17-8~0exp	190。6 kB	431。0 kB	[檔案列表]
armhf	0.7.17-8~0exp	190。1 kB	319。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	0.7.17-8~0exp	225。9 kB	512。0 kB	[檔案列表]
i386	0.7.17-8~0exp	231。7 kB	523。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	0.7.17-8~0exp	291。1 kB	962。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	0.7.17-8~0exp	203。9 kB	471。0 kB	[檔案列表]
mips64el	0.7.17-8~0exp	201。2 kB	527。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	0.7.17-8~0exp	216。9 kB	576。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	0.7.17-8~0exp	226。8 kB	576。0 kB	[檔案列表]
riscv64	0.7.17-8~0exp+b1	214。5 kB	376。0 kB	[檔案列表]
s390x	0.7.17-8~0exp	190。3 kB	464。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	0.7.17-8~0exp	272。9 kB	448。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	0.7.17-8~0exp	182。5 kB	1，092。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	0.7.17-8~0exp	218。3 kB	471。0 kB	[檔案列表]