Пакет: tabix (1.21+ds-1 и другие)

[ Источник: htslib  ]

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This package is built from the HTSlib source, and provides the bgzip, htsfile, and tabix tools.

Теги: Реализовано на: C, Роль: Программа, Наука: science::calculation, use::calculating, Поддерживаемые форматы: HTML, язык гипертекстовой разметки, Работает с: Текст

Другие пакеты, относящиеся к tabix

• dep: libbz2-1.0

  библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, loong64, sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  быстрое сжатие и распаковка блоков данных на основе DEFLATE

• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Custom compression for CRAM and others

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  библиотека для работы с архивами в формате XZ

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  библиотека сжатия

Загрузка tabix

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.21+ds-1	487,6 Кб	2 703,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.21+ds-1	484,1 Кб	2 328,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.21+ds-1	450,1 Кб	2 316,0 Кб	[список файлов]
armel	1.21+ds-1	412,2 Кб	2 249,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.21+ds-1	414,8 Кб	1 609,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	1.21+ds-1	467,0 Кб	2 305,0 Кб	[список файлов]
i386	1.21+ds-1	528,0 Кб	2 629,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.19+ds-1.1+b1	558,6 Кб	4 599,0 Кб	[список файлов]
loong64 (неофициальный перенос)	1.21+ds-1	482,2 Кб	2 572,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1.21+ds-1	432,5 Кб	2 081,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.21+ds-1	446,6 Кб	2 685,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.21+ds-1	500,1 Кб	3 148,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.21+ds-1	516,5 Кб	3 084,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.21+ds-1	497,4 Кб	1 920,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.21+ds-1	472,7 Кб	2 504,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.21+ds-1	500,5 Кб	2 060,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.21+ds-1	407,1 Кб	3 163,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1.21+ds-1	484,6 Кб	2 281,0 Кб	[список файлов]