Пакет: tabix (1.20+ds-2)

[ Источник: htslib  ]

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This package is built from the HTSlib source, and provides the bgzip, htsfile, and tabix tools.

Теги: Реализовано на: C, Роль: Программа, Наука: science::calculation, use::calculating, Поддерживаемые форматы: HTML, язык гипертекстовой разметки, Работает с: Текст

Другие пакеты, относящиеся к tabix

• dep: libbz2-1.0

  библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)

• dep: libc6 (>= 2.34)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  быстрое сжатие и распаковка блоков данных на основе DEFLATE

• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Custom compression for CRAM and others

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  библиотека для работы с архивами в формате XZ

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  библиотека сжатия

Загрузка tabix

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	474,4 Кб	2 293,0 Кб	[список файлов]
arm64	444,0 Кб	2 249,0 Кб	[список файлов]
armel	405,0 Кб	2 058,0 Кб	[список файлов]
armhf	408,2 Кб	1 498,0 Кб	[список файлов]
i386	523,2 Кб	2 610,0 Кб	[список файлов]
mips64el	434,1 Кб	2 617,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	511,2 Кб	3 017,0 Кб	[список файлов]
riscv64	491,8 Кб	1 901,0 Кб	[список файлов]
s390x	467,1 Кб	2 477,0 Кб	[список файлов]