Пакунок: tabix (1.20+ds-2 and others)

Links for tabix

Debian Resources:

Download Source Package htslib:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Charles Plessy (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)
Michael R. Crusoe (QA Page)
Steffen Moeller (QA Page)
Étienne Mollier (QA Page)

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This package is built from the HTSlib source, and provides the bgzip, htsfile, and tabix tools.

Tags: Implemented in: C, Role: Program, Наука: science::calculation, use::calculating, Supports Format: HTML, Hypertext Markup Language, Works with: Text

Інші пакунки пов'язані з tabix

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libbz2-1.0

Стискання файлів за алгоритмом Барроуза-Уїлера — виконавчий модуль
dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libdeflate0 (>= 1.0)

fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression
dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

Custom compression for CRAM and others
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

Бібліотека стиснення даних у формат XZ
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

Завантажити tabix

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	1.20+ds-2	479.1 kB	2,700.0 kB	[список файлів]
amd64	1.20+ds-2	474.4 kB	2,293.0 kB	[список файлів]
arm64	1.20+ds-2	444.0 kB	2,249.0 kB	[список файлів]
armel	1.20+ds-2	405.0 kB	2,058.0 kB	[список файлів]
armhf	1.20+ds-2	408.2 kB	1,498.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	1.20+ds-2	460.7 kB	2,270.0 kB	[список файлів]
i386	1.20+ds-2	523.2 kB	2,610.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	1.19+ds-1.1+b1	558.6 kB	4,599.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	1.20+ds-2	427.6 kB	2,062.0 kB	[список файлів]
mips64el	1.20+ds-2	434.1 kB	2,617.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	1.20+ds-2	494.0 kB	3,145.0 kB	[список файлів]
ppc64el	1.20+ds-2	511.2 kB	3,017.0 kB	[список файлів]
riscv64	1.20+ds-2	491.8 kB	1,901.0 kB	[список файлів]
s390x	1.20+ds-2	467.1 kB	2,477.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	1.20+ds-2	493.4 kB	1,993.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	1.20+ds-2	401.4 kB	3,160.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	1.20+ds-2	475.4 kB	2,238.0 kB	[список файлів]