Paket: tabix (1.20+ds-1 och andra)

Länkar för tabix

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet htslib:

Ansvariga:

Debian Med Packaging Team (QA-sida, E-postarkiv)
Charles Plessy (QA-sida)
Andreas Tille (QA-sida)
Michael R. Crusoe (QA-sida)
Steffen Moeller (QA-sida)
Étienne Mollier (QA-sida)

Externa resurser:

Hemsida [github.com]

Liknande paket:

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This package is built from the HTSlib source, and provides the bgzip, htsfile, and tabix tools.

Märken: Implemented in: C, Role: Program, Vetenskap: science::calculation, use::calculating, Supports Format: HTML, Hypertext Markup Language, Works with: Text

Andra paket besläktade med tabix

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libbz2-1.0

high-quality block-sorting file compressor library - runtime
dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libdeflate0 (>= 1.0)

fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression
dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

Custom compression for CRAM and others
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

XZ-format compression library
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta tabix

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	1.20+ds-1	478,0 kbyte	2.700,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	1.20+ds-1	471,4 kbyte	2.249,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1.20+ds-1	438,8 kbyte	2.249,0 kbyte	[filförteckning]
armel	1.20+ds-1	401,4 kbyte	2.062,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	1.20+ds-1	404,8 kbyte	1.494,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	1.20+ds-1	461,7 kbyte	2.282,0 kbyte	[filförteckning]
i386	1.20+ds-1	517,3 kbyte	2.566,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	1.19+ds-1.1+b1	558,6 kbyte	4.599,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	1.20+ds-1	435,0 kbyte	2.078,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	1.20+ds-1	430,6 kbyte	2.618,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	1.20+ds-1	494,7 kbyte	3.145,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	1.20+ds-1	508,1 kbyte	3.017,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	1.20+ds-1	488,8 kbyte	1.893,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	1.20+ds-1	462,5 kbyte	2.465,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	1.20+ds-1	493,9 kbyte	1.993,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	1.20+ds-1	402,4 kbyte	3.160,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	1.20+ds-1	473,0 kbyte	2.198,0 kbyte	[filförteckning]