Paket: tabix (1.21+ds-1 och andra)

Länkar för tabix

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet htslib:

Ansvariga:

Debian Med Packaging Team (QA-sida, E-postarkiv)
Charles Plessy (QA-sida)
Andreas Tille (QA-sida)
Michael R. Crusoe (QA-sida)
Steffen Moeller (QA-sida)
Étienne Mollier (QA-sida)

Externa resurser:

Hemsida [github.com]

Liknande paket:

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This package is built from the HTSlib source, and provides the bgzip, htsfile, and tabix tools.

Märken: Implemented in: C, Role: Program, Vetenskap: science::calculation, use::calculating, Supports Format: HTML, Hypertext Markup Language, Works with: Text

Andra paket besläktade med tabix

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libbz2-1.0

high-quality block-sorting file compressor library - runtime
dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libdeflate0 (>= 1.0)

fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression
dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

Custom compression for CRAM and others
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

XZ-format compression library
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta tabix

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	1.21+ds-1	487,6 kbyte	2.703,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	1.21+ds-1	484,1 kbyte	2.328,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1.21+ds-1	450,1 kbyte	2.316,0 kbyte	[filförteckning]
armel	1.21+ds-1	412,2 kbyte	2.249,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	1.21+ds-1	414,8 kbyte	1.609,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	1.21+ds-1	467,0 kbyte	2.305,0 kbyte	[filförteckning]
i386	1.21+ds-1	528,0 kbyte	2.629,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	1.19+ds-1.1+b1	558,6 kbyte	4.599,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	1.21+ds-1	432,5 kbyte	2.081,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	1.21+ds-1	446,6 kbyte	2.685,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	1.21+ds-1	500,1 kbyte	3.148,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	1.21+ds-1	516,5 kbyte	3.084,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	1.21+ds-1	497,4 kbyte	1.920,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	1.21+ds-1	472,7 kbyte	2.504,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	1.21+ds-1	500,5 kbyte	2.060,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	1.21+ds-1	407,1 kbyte	3.163,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	1.21+ds-1	484,6 kbyte	2.281,0 kbyte	[filförteckning]