Пакет: tabix (1.20+ds-2 и други)

[ Източник: htslib  ]

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This package is built from the HTSlib source, and provides the bgzip, htsfile, and tabix tools.

Етикети: Implemented in: C, Role: Program, Наука: science::calculation, use::calculating, Supports Format: HTML, Hypertext Markup Language, Works with: Text

Други пакети, свързани с tabix

• dep: libbz2-1.0

  high-quality block-sorting file compressor library - runtime

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression

• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Custom compression for CRAM and others

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  XZ-format compression library

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  compression library - runtime

Изтегляне на tabix

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	1.20+ds-2	479,1 кБ	2 700,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	1.20+ds-2	474,4 кБ	2 293,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.20+ds-2	444,0 кБ	2 249,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.20+ds-2	405,0 кБ	2 058,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.20+ds-2	408,2 кБ	1 498,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	1.20+ds-2	460,7 кБ	2 270,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.20+ds-2	523,2 кБ	2 610,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	1.19+ds-1.1+b1	558,6 кБ	4 599,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	1.20+ds-2	427,6 кБ	2 062,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.20+ds-2	434,1 кБ	2 617,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	1.20+ds-2	494,0 кБ	3 145,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.20+ds-2	511,2 кБ	3 017,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1.20+ds-2	491,8 кБ	1 901,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.20+ds-2	467,1 кБ	2 477,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	1.20+ds-2	493,4 кБ	1 993,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	1.20+ds-2	401,4 кБ	3 160,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	1.20+ds-2	475,4 кБ	2 238,0 кБ	[списък на файловете]