Balík: tabix (1.20+ds-1 a iné)

[ Zdroj: htslib  ]

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This package is built from the HTSlib source, and provides the bgzip, htsfile, and tabix tools.

Značky: Implementované v: C, Role: Program, Veda: science::calculation, use::calculating, Supports Format: HTML, Hypertext Markup Language, Works with: Text

Ostatné balíky súvisiace s balíkom tabix

• dep: libbz2-1.0

  kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression

• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Custom compression for CRAM and others

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  komprimačná knižnica formátu XZ

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť tabix

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	1.20+ds-1	478.0 kB	2,700.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	1.20+ds-1	471.4 kB	2,249.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.20+ds-1	438.8 kB	2,249.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1.20+ds-1	401.4 kB	2,062.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1.20+ds-1	404.8 kB	1,494.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	1.20+ds-1	461.7 kB	2,282.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1.20+ds-1	517.3 kB	2,566.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	1.19+ds-1.1+b1	558.6 kB	4,599.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	1.20+ds-1	435.0 kB	2,078.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.20+ds-1	430.6 kB	2,618.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	1.20+ds-1	494.7 kB	3,145.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.20+ds-1	508.1 kB	3,017.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.20+ds-1	488.8 kB	1,893.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.20+ds-1	462.5 kB	2,465.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	1.20+ds-1	493.9 kB	1,993.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	1.20+ds-1	402.4 kB	3,160.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	1.20+ds-1	473.0 kB	2,198.0 kB	[zoznam súborov]