Пакет: tabix (1.16+ds-3)

[ Источник: htslib  ]

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This package is built from the HTSlib source, and provides the bgzip, htsfile, and tabix tools.

Теги: Реализовано на: C, Роль: Программа, Наука: science::calculation, use::calculating, Поддерживаемые форматы: HTML, язык гипертекстовой разметки, Работает с: Текст

Другие пакеты, относящиеся к tabix

• dep: libbz2-1.0

  библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)

• dep: libc6 (>= 2.34)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  быстрое сжатие и распаковка блоков данных на основе DEFLATE

• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Custom compression for CRAM and others

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  библиотека для работы с архивами в формате XZ

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  библиотека сжатия

Загрузка tabix

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	446,3 Кб	2 185,0 Кб	[список файлов]
arm64	417,1 Кб	2 177,0 Кб	[список файлов]
armel	378,0 Кб	2 046,0 Кб	[список файлов]
armhf	378,6 Кб	1 534,0 Кб	[список файлов]
i386	489,4 Кб	2 478,0 Кб	[список файлов]
mips64el	411,8 Кб	2 541,0 Кб	[список файлов]
mipsel	425,5 Кб	2 532,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	481,2 Кб	2 945,0 Кб	[список файлов]
s390x	404,3 Кб	2 293,0 Кб	[список файлов]