Package: tabix (1.20+ds-2 and others)

Links for tabix

Debian Resources:

Download Source Package htslib:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Charles Plessy (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)
Michael R. Crusoe (QA Page)
Steffen Moeller (QA Page)
Étienne Mollier (QA Page)

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

indexador genérico para arquivos de posicionamento de genoma delimitados por TAB

Tabix indexa arquivos nos quais algumas colunas indicam coordenadas de sequência: nome (em geral um cromossomo), começo e fim. Os dados de entrada devem ser ordenados pela posição e comprimidos com bgzip (fornecido neste pacote), que tem uma interface semelhante ao gzip. Depois da indexação, tabix pode recuperar rapidamente linhas de dados por coordenadas de cromossomos. A recuperação rápida de dados também se dá por rede se uma URI for dada como nome de arquivo.

Este pacote foi construído com a fonte HTSlib, e fornece as ferramentas bgzip, htsfile e tabix.

Tags: Implemented in: C, Role: Program, Science: science::calculation, use::calculating, Supports Format: HTML, Hypertext Markup Language, Works with: Text

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GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
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dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libdeflate0 (>= 1.0)

compressor e descompressor derivado de DEFLATE rápido e de buffer inteiro
dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

Custom compression for CRAM and others
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

biblioteca de compressão para formato XZ
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

Download tabix

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	1.20+ds-2	479.1 kB	2,700.0 kB	[list of files]
amd64	1.20+ds-2	474.4 kB	2,293.0 kB	[list of files]
arm64	1.20+ds-2	444.0 kB	2,249.0 kB	[list of files]
armel	1.20+ds-2	405.0 kB	2,058.0 kB	[list of files]
armhf	1.20+ds-2	408.2 kB	1,498.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	1.20+ds-2	460.7 kB	2,270.0 kB	[list of files]
i386	1.20+ds-2	523.2 kB	2,610.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	1.19+ds-1.1+b1	558.6 kB	4,599.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	1.20+ds-2	427.6 kB	2,062.0 kB	[list of files]
mips64el	1.20+ds-2	434.1 kB	2,617.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	1.20+ds-2	494.0 kB	3,145.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.20+ds-2	511.2 kB	3,017.0 kB	[list of files]
riscv64	1.20+ds-2	491.8 kB	1,901.0 kB	[list of files]
s390x	1.20+ds-2	467.1 kB	2,477.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	1.20+ds-2	493.4 kB	1,993.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	1.20+ds-2	401.4 kB	3,160.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	1.20+ds-2	475.4 kB	2,238.0 kB	[list of files]