パッケージ: tabix (1.20+ds-2 など)

tabix に関するリンク

Debian の資源:

htslib ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [github.com]

類似のパッケージ:

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This package is built from the HTSlib source, and provides the bgzip, htsfile, and tabix tools.

タグ: 実装言語: C, 役割: プログラム, 科学: science::calculation, use::calculating, サポート形式: HyperText Markup Language (HTML), 取り扱い対象: テキスト

その他の tabix 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libbz2-1.0

高品質なブロックソートファイル圧縮器 - ランタイム
dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 以外]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libdeflate0 (>= 1.0)

fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression
dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

Custom compression for CRAM and others
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

XZ 形式の圧縮ライブラリ
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

圧縮ライブラリ - ランタイム

tabix のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.20+ds-2	479.1 kB	2,700.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.20+ds-2	474.4 kB	2,293.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.20+ds-2	444.0 kB	2,249.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.20+ds-2	405.0 kB	2,058.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.20+ds-2	408.2 kB	1,498.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	1.20+ds-2	460.7 kB	2,270.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.20+ds-2	523.2 kB	2,610.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.19+ds-1.1+b1	558.6 kB	4,599.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.20+ds-2	427.6 kB	2,062.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.20+ds-2	434.1 kB	2,617.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.20+ds-2	494.0 kB	3,145.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.20+ds-2	511.2 kB	3,017.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.20+ds-2	491.8 kB	1,901.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.20+ds-2	467.1 kB	2,477.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.20+ds-2	493.4 kB	1,993.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.20+ds-2	401.4 kB	3,160.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.20+ds-2	475.4 kB	2,238.0 kB	[ファイル一覧]