套件：tabix（1.20+ds-2 以及其他的）

[ 原始碼： htslib  ]

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This package is built from the HTSlib source, and provides the bgzip, htsfile, and tabix tools.

標籤: 實做語言: C, 角色: 程式, 科學: science::calculation, use::calculating, 支援的格式: HTML, 超本文標記語言, 處理: 文字

其他與 tabix 有關的套件

• dep: libbz2-1.0

  high-quality block-sorting file compressor library - runtime

• dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, sh4]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression

• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Custom compression for CRAM and others

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  XZ-format compression library

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)

下載 tabix

下載可用於所有硬體架構的

硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	1.20+ds-2	479。1 kB	2，700。0 kB	[檔案列表]
amd64	1.20+ds-2	474。4 kB	2，293。0 kB	[檔案列表]
arm64	1.20+ds-2	444。0 kB	2，249。0 kB	[檔案列表]
armel	1.20+ds-2	405。0 kB	2，058。0 kB	[檔案列表]
armhf	1.20+ds-2	408。2 kB	1，498。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	1.20+ds-2	460。7 kB	2，270。0 kB	[檔案列表]
i386	1.20+ds-2	523。2 kB	2，610。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	1.19+ds-1.1+b1	558。6 kB	4，599。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	1.20+ds-2	427。6 kB	2，062。0 kB	[檔案列表]
mips64el	1.20+ds-2	434。1 kB	2，617。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	1.20+ds-2	494。0 kB	3，145。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	1.20+ds-2	511。2 kB	3，017。0 kB	[檔案列表]
riscv64	1.20+ds-2	491。8 kB	1，901。0 kB	[檔案列表]
s390x	1.20+ds-2	467。1 kB	2，477。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	1.20+ds-2	493。4 kB	1，993。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	1.20+ds-2	401。4 kB	3，160。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	1.20+ds-2	475。4 kB	2，238。0 kB	[檔案列表]