Пакет: tabix (1.20+ds-1 и други)

[ Източник: htslib  ]

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This package is built from the HTSlib source, and provides the bgzip, htsfile, and tabix tools.

Етикети: Implemented in: C, Role: Program, Наука: science::calculation, use::calculating, Supports Format: HTML, Hypertext Markup Language, Works with: Text

Други пакети, свързани с tabix

• dep: libbz2-1.0

  high-quality block-sorting file compressor library - runtime

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression

• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Custom compression for CRAM and others

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  XZ-format compression library

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  compression library - runtime

Изтегляне на tabix

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	1.20+ds-1+b1	475,2 кБ	2 294,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.20+ds-1	438,8 кБ	2 249,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.20+ds-1+b1	404,2 кБ	2 059,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.20+ds-1+b1	408,0 кБ	1 499,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.20+ds-1+b1	523,4 кБ	2 611,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.20+ds-1+b1	434,4 кБ	2 618,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.20+ds-1+b1	511,2 кБ	3 018,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1.20+ds-1+b1	492,3 кБ	1 902,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.20+ds-1+b1	467,3 кБ	2 478,0 кБ	[списък на файловете]