Пакунок: tabix (1.20+ds-1 and others)

[ Source: htslib  ]

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This package is built from the HTSlib source, and provides the bgzip, htsfile, and tabix tools.

Tags: Implemented in: C, Role: Program, Наука: science::calculation, use::calculating, Supports Format: HTML, Hypertext Markup Language, Works with: Text

Інші пакунки пов'язані з tabix

• dep: libbz2-1.0

  Стискання файлів за алгоритмом Барроуза-Уїлера — виконавчий модуль

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression

• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Custom compression for CRAM and others

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  Бібліотека стиснення даних у формат XZ

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

Завантажити tabix

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	1.20+ds-1+b1	475.2 kB	2,294.0 kB	[список файлів]
arm64	1.20+ds-1	438.8 kB	2,249.0 kB	[список файлів]
armel	1.20+ds-1+b1	404.2 kB	2,059.0 kB	[список файлів]
armhf	1.20+ds-1+b1	408.0 kB	1,499.0 kB	[список файлів]
i386	1.20+ds-1+b1	523.4 kB	2,611.0 kB	[список файлів]
mips64el	1.20+ds-1+b1	434.4 kB	2,618.0 kB	[список файлів]
ppc64el	1.20+ds-1+b1	511.2 kB	3,018.0 kB	[список файлів]
riscv64	1.20+ds-1+b1	492.3 kB	1,902.0 kB	[список файлів]
s390x	1.20+ds-1+b1	467.3 kB	2,478.0 kB	[список файлів]