Paket: tabix (1.20+ds-1 och andra)

[ Källkod: htslib  ]

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This package is built from the HTSlib source, and provides the bgzip, htsfile, and tabix tools.

Märken: Implemented in: C, Role: Program, Vetenskap: science::calculation, use::calculating, Supports Format: HTML, Hypertext Markup Language, Works with: Text

Andra paket besläktade med tabix

• dep: libbz2-1.0

  high-quality block-sorting file compressor library - runtime

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression

• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Custom compression for CRAM and others

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  XZ-format compression library

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta tabix

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	1.20+ds-1+b1	475,2 kbyte	2.294,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1.20+ds-1	438,8 kbyte	2.249,0 kbyte	[filförteckning]
armel	1.20+ds-1+b1	404,2 kbyte	2.059,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	1.20+ds-1+b1	408,0 kbyte	1.499,0 kbyte	[filförteckning]
i386	1.20+ds-1+b1	523,4 kbyte	2.611,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	1.20+ds-1+b1	434,4 kbyte	2.618,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	1.20+ds-1+b1	511,2 kbyte	3.018,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	1.20+ds-1+b1	492,3 kbyte	1.902,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	1.20+ds-1+b1	467,3 kbyte	2.478,0 kbyte	[filförteckning]