alla flaggor
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Källkod: ggd-utils  ]

Paket: ggd-utils (1.0.0+ds-1 och andra)

Länkar för ggd-utils

Screenshot

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet ggd-utils:

Ansvariga:

Externa resurser:

Liknande paket:

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Andra paket besläktade med ggd-utils

  • beror
  • rekommenderar
  • föreslår
  • enhances

Hämta ggd-utils

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur Version Paketstorlek Installerad storlek Filer
alpha (inofficiell anpassning) 1.0.0+ds-1+b9 190,5 kbyte759,0 kbyte [filförteckning]
amd64 1.0.0+ds-1+b16 2.206,1 kbyte6.605,0 kbyte [filförteckning]
arm64 1.0.0+ds-1+b16 1.895,3 kbyte6.162,0 kbyte [filförteckning]
armel 1.0.0+ds-1+b16 1.964,1 kbyte6.504,0 kbyte [filförteckning]
armhf 1.0.0+ds-1+b16 1.958,5 kbyte6.504,0 kbyte [filförteckning]
i386 1.0.0+ds-1+b16 2.127,9 kbyte6.428,0 kbyte [filförteckning]
loong64 (inofficiell anpassning) 1.0.0+ds-1+b5 1.790,6 kbyte6.011,0 kbyte [filförteckning]
mips64el 1.0.0+ds-1+b16 1.791,9 kbyte7.204,0 kbyte [filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning) 1.0.0+ds-1+b9 219,6 kbyte1.088,0 kbyte [filförteckning]
ppc64el 1.0.0+ds-1+b16 1.888,7 kbyte6.417,0 kbyte [filförteckning]
riscv64 1.0.0+ds-1+b11 1.962,8 kbyte6.225,0 kbyte [filförteckning]
s390x 1.0.0+ds-1+b16 2.005,8 kbyte6.865,0 kbyte [filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning) 1.0.0+ds-1+b8 187,8 kbyte1.274,0 kbyte [filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning) 1.0.0+ds-1+b9 199,3 kbyte716,0 kbyte [filförteckning]