všetky možnosti
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Zdroj: ggd-utils  ]

Balík: ggd-utils (1.0.0+ds-1 a iné)

Odkazy pre ggd-utils

Screenshot

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík ggd-utils:

Správcovia:

Externé zdroje:

Podobné balíky:

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Ostatné balíky súvisiace s balíkom ggd-utils

  • závisí
  • odporúča
  • navrhuje
  • vylepšuje

Stiahnuť ggd-utils

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra Verzia Veľkosť balíka Nainštalovaná veľkosť Súbory
alpha (neoficiálny port) 1.0.0+ds-1+b9 190.5 kB759.0 kB [zoznam súborov]
amd64 1.0.0+ds-1+b16 2,206.1 kB6,605.0 kB [zoznam súborov]
arm64 1.0.0+ds-1+b16 1,895.3 kB6,162.0 kB [zoznam súborov]
armel 1.0.0+ds-1+b16 1,964.1 kB6,504.0 kB [zoznam súborov]
armhf 1.0.0+ds-1+b16 1,958.5 kB6,504.0 kB [zoznam súborov]
i386 1.0.0+ds-1+b16 2,127.9 kB6,428.0 kB [zoznam súborov]
loong64 (neoficiálny port) 1.0.0+ds-1+b5 1,790.6 kB6,011.0 kB [zoznam súborov]
mips64el 1.0.0+ds-1+b16 1,791.9 kB7,204.0 kB [zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port) 1.0.0+ds-1+b9 219.6 kB1,088.0 kB [zoznam súborov]
ppc64el 1.0.0+ds-1+b16 1,888.7 kB6,417.0 kB [zoznam súborov]
riscv64 1.0.0+ds-1+b11 1,962.8 kB6,225.0 kB [zoznam súborov]
s390x 1.0.0+ds-1+b16 2,005.8 kB6,865.0 kB [zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port) 1.0.0+ds-1+b8 187.8 kB1,274.0 kB [zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port) 1.0.0+ds-1+b9 199.3 kB716.0 kB [zoznam súborov]