Paket: ggd-utils (0.0.7+ds-3 och andra)

[ Källkod: ggd-utils  ]

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Andra paket besläktade med ggd-utils

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.3.6-6~) [i386]

  dep: libc6 (>= 2.4) [ej arm64, i386, ppc64el]

Hämta ggd-utils

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	0.0.7+ds-3+b6	1.685,4 kbyte	5.273,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	0.0.7+ds-3+b6	1.441,3 kbyte	4.860,0 kbyte	[filförteckning]
armel	0.0.7+ds-3+b6	1.470,3 kbyte	4.508,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	0.0.7+ds-3+b6	1.465,2 kbyte	4.444,0 kbyte	[filförteckning]
i386	0.0.7+ds-3+b6	1.601,7 kbyte	4.482,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	0.0.7+ds-3+b6	1.362,7 kbyte	5.335,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	0.0.7+ds-3+b6	1.385,8 kbyte	4.987,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	0.0.7+ds-3+b6	1.415,6 kbyte	4.924,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	0.0.7+ds-3+b6	1.545,2 kbyte	5.183,0 kbyte	[filförteckning]