Paket: ggd-utils (1.0.0+ds-1 ve diğerleri)

[ Kaynak: ggd-utils  ]

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

ggd-utils ile İlgili Diğer Paketler

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha değil]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [ppc64, x32]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sparc64]

• dep: libgo22 [alpha, ppc64, sparc64, x32]

  Runtime library for GNU Go applications

ggd-utils indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	1.0.0+ds-1+b9	190,5 kB	759,0 kB	[dosya listesi]
amd64	1.0.0+ds-1+b14	2.205,7 kB	6.605,0 kB	[dosya listesi]
arm64	1.0.0+ds-1+b14	1.895,4 kB	6.162,0 kB	[dosya listesi]
armel	1.0.0+ds-1+b14	1.965,6 kB	6.504,0 kB	[dosya listesi]
armhf	1.0.0+ds-1+b14	1.958,2 kB	6.504,0 kB	[dosya listesi]
i386	1.0.0+ds-1+b14	2.124,4 kB	6.420,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	1.0.0+ds-1+b14	1.791,7 kB	7.204,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	1.0.0+ds-1+b9	219,6 kB	1.088,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	1.0.0+ds-1+b14	1.889,3 kB	6.417,0 kB	[dosya listesi]
riscv64	1.0.0+ds-1+b9	1.964,7 kB	6.289,0 kB	[dosya listesi]
s390x	1.0.0+ds-1+b14	2.003,5 kB	6.865,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	1.0.0+ds-1+b8	187,8 kB	1.274,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	1.0.0+ds-1+b9	199,3 kB	716,0 kB	[dosya listesi]