all options
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: ggd-utils  ]

Package: ggd-utils (1.0.0+ds-1 and others)

Links for ggd-utils

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package ggd-utils:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Programmer til brug i ggd

Anvender en genomfil og (i øjeblikket) en .vcf.gz eller en .bed.gz og kontrollerer at:

 * en .tbi er til stede
 * VCF'en har ""##fileformat=VCF" som den første linje
 * VCF'en har et #CHROM-teksthoved
 * kromosomen er i rækkefølgen angivet af genomfilen (og til stede)
 * positionerne er sorteret
 * positionerne er <= kromosomlængderne defineret i genomfilen

Som resultat vil ethvert nyt genom, der går ind i GGD, have en .genom-fil, der dikterer sorteringsrækkefølgen og tilstedeværelse eller fravær af »chr«-præfikset for kromosomer.

Other Packages Related to ggd-utils

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download ggd-utils

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
alpha (unofficial port) 1.0.0+ds-1+b9 190.5 kB759.0 kB [list of files]
amd64 1.0.0+ds-1+b12 2,113.8 kB6,191.0 kB [list of files]
arm64 1.0.0+ds-1+b12 1,826.3 kB5,884.0 kB [list of files]
armel 1.0.0+ds-1+b12 1,798.6 kB6,035.0 kB [list of files]
armhf 1.0.0+ds-1+b12 1,792.8 kB6,035.0 kB [list of files]
i386 1.0.0+ds-1+b12 1,953.0 kB5,991.0 kB [list of files]
mips64el 1.0.0+ds-1+b12 1,635.5 kB6,734.0 kB [list of files]
ppc64 (unofficial port) 1.0.0+ds-1+b9 219.6 kB1,088.0 kB [list of files]
ppc64el 1.0.0+ds-1+b12 1,813.2 kB6,074.0 kB [list of files]
riscv64 1.0.0+ds-1+b7 1,791.5 kB5,819.0 kB [list of files]
s390x 1.0.0+ds-1+b12 1,922.3 kB6,523.0 kB [list of files]
sparc64 (unofficial port) 1.0.0+ds-1+b8 187.8 kB1,274.0 kB [list of files]
x32 (unofficial port) 1.0.0+ds-1+b9 199.3 kB716.0 kB [list of files]