Пакет: ggd-utils (1.0.0+ds-1 и другие)

[ Источник: ggd-utils  ]

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Другие пакеты, относящиеся к ggd-utils

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [ppc64, x32]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sparc64]

• dep: libgo22 [alpha, ppc64, sparc64, x32]

  Runtime library for GNU Go applications

Загрузка ggd-utils

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.0.0+ds-1+b9	190,5 Кб	759,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.0.0+ds-1+b11	2 114,9 Кб	6 191,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.0.0+ds-1+b11	1 824,6 Кб	5 884,0 Кб	[список файлов]
armel	1.0.0+ds-1+b11	1 799,6 Кб	6 035,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.0.0+ds-1+b11	1 792,7 Кб	6 035,0 Кб	[список файлов]
i386	1.0.0+ds-1+b11	1 952,2 Кб	5 991,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.0.0+ds-1+b11	1 634,9 Кб	6 734,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.0.0+ds-1+b9	219,6 Кб	1 088,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.0.0+ds-1+b11	1 813,7 Кб	6 074,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.0.0+ds-1+b6	1 791,9 Кб	5 819,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.0.0+ds-1+b11	1 922,1 Кб	6 523,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.0.0+ds-1+b8	187,8 Кб	1 274,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1.0.0+ds-1+b9	199,3 Кб	716,0 Кб	[список файлов]