Pakiet: ggd-utils (1.0.0+ds-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: ggd-utils  ]

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Inne pakiety związane z ggd-utils

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [ppc64, x32]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sparc64]

• dep: libgo22 [alpha, ppc64, sparc64, x32]

  Runtime library for GNU Go applications

Pobieranie ggd-utils

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.0.0+ds-1+b9	190,5 KiB	759,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.0.0+ds-1+b13	2 115,2 KiB	6 195,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.0.0+ds-1+b13	1 826,0 KiB	5 884,0 KiB	[lista plików]
armel	1.0.0+ds-1+b13	1 800,6 KiB	6 035,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.0.0+ds-1+b13	1 794,0 KiB	6 035,0 KiB	[lista plików]
i386	1.0.0+ds-1+b13	1 953,0 KiB	5 995,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.0.0+ds-1+b13	1 636,7 KiB	6 734,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.0.0+ds-1+b9	219,6 KiB	1 088,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.0.0+ds-1+b13	1 814,1 KiB	6 074,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.0.0+ds-1+b8	1 792,5 KiB	5 819,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.0.0+ds-1+b13	1 922,9 KiB	6 523,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.0.0+ds-1+b8	187,8 KiB	1 274,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.0.0+ds-1+b9	199,3 KiB	716,0 KiB	[lista plików]