всички настройки
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Източник: ggd-utils  ]

Пакет: ggd-utils (1.0.0+ds-1 и други)

Връзки за ggd-utils

Screenshot

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник ggd-utils.

Отговорници:

Външни препратки:

Подобни пакети:

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Други пакети, свързани с ggd-utils

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на ggd-utils

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Версия Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
alpha (неофициална архитектура) 1.0.0+ds-1+b9 190,5 кБ759,0 кБ [списък на файловете]
amd64 1.0.0+ds-1+b16 2 206,1 кБ6 605,0 кБ [списък на файловете]
arm64 1.0.0+ds-1+b16 1 895,3 кБ6 162,0 кБ [списък на файловете]
armel 1.0.0+ds-1+b16 1 964,1 кБ6 504,0 кБ [списък на файловете]
armhf 1.0.0+ds-1+b16 1 958,5 кБ6 504,0 кБ [списък на файловете]
i386 1.0.0+ds-1+b16 2 127,9 кБ6 428,0 кБ [списък на файловете]
loong64 (неофициална архитектура) 1.0.0+ds-1+b5 1 790,6 кБ6 011,0 кБ [списък на файловете]
mips64el 1.0.0+ds-1+b16 1 791,9 кБ7 204,0 кБ [списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура) 1.0.0+ds-1+b9 219,6 кБ1 088,0 кБ [списък на файловете]
ppc64el 1.0.0+ds-1+b16 1 888,7 кБ6 417,0 кБ [списък на файловете]
riscv64 1.0.0+ds-1+b11 1 962,8 кБ6 225,0 кБ [списък на файловете]
s390x 1.0.0+ds-1+b16 2 005,8 кБ6 865,0 кБ [списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура) 1.0.0+ds-1+b8 187,8 кБ1 274,0 кБ [списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура) 1.0.0+ds-1+b9 199,3 кБ716,0 кБ [списък на файловете]