Paket: ggd-utils (1.0.0+ds-1 och andra)

[ Källkod: ggd-utils  ]

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Andra paket besläktade med ggd-utils

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

Hämta ggd-utils

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	1.0.0+ds-1+b13	2.115,2 kbyte	6.195,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1.0.0+ds-1+b13	1.826,0 kbyte	5.884,0 kbyte	[filförteckning]
armel	1.0.0+ds-1+b13	1.800,6 kbyte	6.035,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	1.0.0+ds-1+b13	1.794,0 kbyte	6.035,0 kbyte	[filförteckning]
i386	1.0.0+ds-1+b13	1.953,0 kbyte	5.995,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	1.0.0+ds-1+b13	1.636,7 kbyte	6.734,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	1.0.0+ds-1+b13	1.814,1 kbyte	6.074,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	1.0.0+ds-1+b8	1.792,5 kbyte	5.819,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	1.0.0+ds-1+b13	1.922,9 kbyte	6.523,0 kbyte	[filförteckning]