Balík: ggd-utils (0.0.7+ds-3 a iné)

[ Zdroj: ggd-utils  ]

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Ostatné balíky súvisiace s balíkom ggd-utils

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.3.6-6~) [i386]

  dep: libc6 (>= 2.4) [nie arm64, i386, ppc64el]

Stiahnuť ggd-utils

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	0.0.7+ds-3+b6	1,685.4 kB	5,273.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	0.0.7+ds-3+b6	1,441.3 kB	4,860.0 kB	[zoznam súborov]
armel	0.0.7+ds-3+b6	1,470.3 kB	4,508.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	0.0.7+ds-3+b6	1,465.2 kB	4,444.0 kB	[zoznam súborov]
i386	0.0.7+ds-3+b6	1,601.7 kB	4,482.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	0.0.7+ds-3+b6	1,362.7 kB	5,335.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	0.0.7+ds-3+b6	1,385.8 kB	4,987.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	0.0.7+ds-3+b6	1,415.6 kB	4,924.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	0.0.7+ds-3+b6	1,545.2 kB	5,183.0 kB	[zoznam súborov]