Balík: ggd-utils (1.0.0+ds-1 a iné)

[ Zdroj: ggd-utils  ]

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Ostatné balíky súvisiace s balíkom ggd-utils

• dep: libc6 (>= 2.34)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

Stiahnuť ggd-utils

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	1.0.0+ds-1+b6	1,775.3 kB	5,126.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.0.0+ds-1+b6	1,530.8 kB	4,842.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1.0.0+ds-1+b6	1,515.0 kB	4,907.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1.0.0+ds-1+b6	1,507.8 kB	4,883.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1.0.0+ds-1+b6	1,651.4 kB	4,956.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.0.0+ds-1+b6	1,379.6 kB	5,565.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	1.0.0+ds-1+b6	1,412.2 kB	5,462.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.0.0+ds-1+b6	1,497.5 kB	4,905.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.0.0+ds-1+b6	1,619.4 kB	5,246.0 kB	[zoznam súborov]