Package: tabix (1.16+ds-3)

[ Source: htslib  ]

indexador genérico para arquivos de posicionamento de genoma delimitados por TAB

Tabix indexa arquivos nos quais algumas colunas indicam coordenadas de sequência: nome (em geral um cromossomo), começo e fim. Os dados de entrada devem ser ordenados pela posição e comprimidos com bgzip (fornecido neste pacote), que tem uma interface semelhante ao gzip. Depois da indexação, tabix pode recuperar rapidamente linhas de dados por coordenadas de cromossomos. A recuperação rápida de dados também se dá por rede se uma URI for dada como nome de arquivo.

Este pacote foi construído com a fonte HTSlib, e fornece as ferramentas bgzip, htsfile e tabix.

Tags: Implemented in: C, Role: Program, Science: science::calculation, use::calculating, Supports Format: HTML, Hypertext Markup Language, Works with: Text

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  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  also a virtual package provided by libc6-udeb

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• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Custom compression for CRAM and others

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  biblioteca de compressão para formato XZ

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

Download tabix

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	446.3 kB	2,185.0 kB	[list of files]
arm64	417.1 kB	2,177.0 kB	[list of files]
armel	378.0 kB	2,046.0 kB	[list of files]
armhf	378.6 kB	1,534.0 kB	[list of files]
i386	489.4 kB	2,478.0 kB	[list of files]
mips64el	411.8 kB	2,541.0 kB	[list of files]
mipsel	425.5 kB	2,532.0 kB	[list of files]
ppc64el	481.2 kB	2,945.0 kB	[list of files]
s390x	404.3 kB	2,293.0 kB	[list of files]