Pakiet: ggd-utils (1.0.0+ds-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: ggd-utils  ]

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Inne pakiety związane z ggd-utils

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

Pobieranie ggd-utils

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1.0.0+ds-1+b16	2 206,1 KiB	6 605,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.0.0+ds-1+b16	1 895,3 KiB	6 162,0 KiB	[lista plików]
armel	1.0.0+ds-1+b16	1 964,1 KiB	6 504,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.0.0+ds-1+b16	1 958,5 KiB	6 504,0 KiB	[lista plików]
i386	1.0.0+ds-1+b16	2 127,9 KiB	6 428,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.0.0+ds-1+b16	1 791,9 KiB	7 204,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.0.0+ds-1+b16	1 888,7 KiB	6 417,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.0.0+ds-1+b11	1 962,8 KiB	6 225,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.0.0+ds-1+b16	2 005,8 KiB	6 865,0 KiB	[lista plików]