Pakiet: ggd-utils (0.0.7+ds-3 i inne)

[ Pakiet źródłowy: ggd-utils  ]

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Inne pakiety związane z ggd-utils

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.3.6-6~) [i386]

  dep: libc6 (>= 2.4) [nie arm64, i386, ppc64el]

Pobieranie ggd-utils

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	0.0.7+ds-3+b6	1 685,4 KiB	5 273,0 KiB	[lista plików]
arm64	0.0.7+ds-3+b6	1 441,3 KiB	4 860,0 KiB	[lista plików]
armel	0.0.7+ds-3+b6	1 470,3 KiB	4 508,0 KiB	[lista plików]
armhf	0.0.7+ds-3+b6	1 465,2 KiB	4 444,0 KiB	[lista plików]
i386	0.0.7+ds-3+b6	1 601,7 KiB	4 482,0 KiB	[lista plików]
mips64el	0.0.7+ds-3+b6	1 362,7 KiB	5 335,0 KiB	[lista plików]
mipsel	0.0.7+ds-3+b6	1 385,8 KiB	4 987,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	0.0.7+ds-3+b6	1 415,6 KiB	4 924,0 KiB	[lista plików]
s390x	0.0.7+ds-3+b6	1 545,2 KiB	5 183,0 KiB	[lista plików]