Package: srst2 (0.2.0-13 and others)

[ Source: srst2  ]

tipizzazione di sequenze di letture corte per batteri patogeni

Questo programma è progettato per prendere dati di sequenziamento Illumina, un database MLST e/o un database di sequenze geniche (es. geni di resistenza, geni di virulenza, ecc.) e riporta la presenza di ST o di geni di riferimento.

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  Package not available

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• dep: python-scipy [hppa, x32]

  Package not available

• dep: python3 [not hppa, x32]

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-biopython [not hppa, x32]

  libreria Python 3 per bioinformatica

• dep: python3-scipy [not hppa, x32]

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• dep: samtools

  elaborazioni di allineamenti di sequenze nei formati SAM, BAM e CRAM

• rec: python3-rpy2

  interfaccia Python3 al linguaggio ed all'ambiente GNU R (versione 2)

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	0.2.0-13	59.8 kB	265.0 kB	[list of files]
amd64	0.2.0-13	59.9 kB	265.0 kB	[list of files]
arm64	0.2.0-13	59.9 kB	265.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	0.1.8-1	58.6 kB	258.0 kB	[list of files]
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m68k (unofficial port)	0.2.0-13	59.9 kB	265.0 kB	[list of files]
mips64el	0.2.0-13	59.9 kB	265.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	0.2.0-13	59.8 kB	265.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.2.0-13	59.9 kB	265.0 kB	[list of files]
riscv64	0.2.0-13	59.9 kB	265.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	0.2.0-13	59.8 kB	265.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	0.2.0-13	59.9 kB	265.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	0.1.8-1	58.6 kB	258.0 kB	[list of files]