Paket: srst2 (0.2.0-13 und andere)

[ Quellcode: srst2  ]

Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens

This program is designed to take Illumina sequence data, a MLST database and/or a database of gene sequences (e.g. resistance genes, virulence genes, etc) and report the presence of STs and/or reference genes.

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  Paket nicht verfügbar

• dep: python-biopython [hppa, x32]

  Python-Bibliothek für die Bioinformatik (implementiert in Python 2)

• dep: python-scipy [hppa, x32]

  Paket nicht verfügbar

• dep: python3 [nicht hppa, x32]

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-biopython [nicht hppa, x32]

  Python-3-Bibliothek für die Bioinformatik

• dep: python3-scipy [nicht hppa, x32]

  Wissenschaftliche Werkzeuge für Python 3

• dep: samtools

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• rec: python3-rpy2

  Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)

srst2 herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	0.2.0-13	59,8 kB	265,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	0.2.0-13	59,9 kB	265,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	0.2.0-13	59,9 kB	265,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	0.1.8-1	58,6 kB	258,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	0.2.0-11	59,6 kB	254,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	0.2.0-13	59,9 kB	265,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	0.2.0-13	59,9 kB	265,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	0.2.0-13	59,9 kB	265,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	0.2.0-13	59,8 kB	265,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	0.2.0-13	59,9 kB	265,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	0.2.0-13	59,9 kB	265,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	0.2.0-13	59,8 kB	265,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	0.2.0-13	59,9 kB	265,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	0.1.8-1	58,6 kB	258,0 kB	[Liste der Dateien]