Paket: python-biopython (1.70+dfsg-2 und andere) [debports]

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Python-Bibliothek für die Bioinformatik (implementiert in Python 2)

Das Projekt Biopython ist eine internationale Vereinigung von Entwicklern frei verfügbarer Python-Werkzeuge für rechnergestützte Molekularbiologie.

Es ist eine verteilte, gemeinsame Anstrengung zur Entwicklung von Python-Bibliotheken und -Applikationen, die auf die Anforderungen der aktuellen und zukünftigen Arbeit in der Bioinformatik zugeschnitten sind. Der Quelltext ist unter der »Biopython License« verfügbar, welche sehr liberal ist und kompatibel mit fast jeder Lizenz. Das Projekt arbeitet gemeinsam mit der Open Bioinformatics Foundation, die für das Projekt Speicherplatz für CVS und für die Webseiten bereitstellt.

Dieses Paket ist für die Python-Version 2 zuständig.

Andere Pakete mit Bezug zu python-biopython

• dep: libc6 (>= 2.3.4) [hppa]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.4) [sparc64]

• dep: python [sparc64]

  Paket nicht verfügbar

  dep: python (<< 2.8)

  dep: python (>= 2.7)

• dep: python-numpy (>= 1:1.10.0~b1) [sparc64]

  Paket nicht verfügbar

  dep: python-numpy (>= 1:1.8.0) [hppa]

• dep: python-numpy-abi9

  Paket nicht verfügbar

• dep: python-reportlab

  Paket nicht verfügbar

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• rec: python-biopython-doc (= 1.65+dfsg-1) [hppa]

  Dokumentation für die Biopython-Bibliothek

  rec: python-biopython-doc (= 1.70+dfsg-2) [sparc64]

• sug: clustalo

  General-purpose multiple sequence alignment program for proteins

• sug: clustalw

  Globale multiple Alignments von Nukleotid- oder Peptidsequenzen

• sug: dialign

  Segmentbasiertes multiples Sequenzalignment

• sug: dssp

  protein secondary structure assignment based on 3D structure

• sug: emboss

  Europäische, quelloffene Software-Suite für Molekularbiologie

• sug: fasttree

  phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences

• sug: mafft

  Programm für multiples Alignment von Aminosäure- oder Nukleotidsequenzen

• sug: muscle

  Multiple alignment program of protein sequences

• sug: phylip [sparc64]

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: phyml

  Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood

• sug: prank

  Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences

• sug: probcons

  PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment

• sug: python-matplotlib

  Paket nicht verfügbar

• sug: python-mysqldb

  Paket nicht verfügbar

• sug: python-pil

  Paket nicht verfügbar

• sug: python-psycopg2

  Paket nicht verfügbar

• sug: python-rdflib (>= 4)

  Paket nicht verfügbar

• sug: python-renderpm

  Paket nicht verfügbar

• sug: python-scipy [sparc64]

  Paket nicht verfügbar

• sug: python-tk

  Paket nicht verfügbar

• sug: raxml

  Randomized Axelerated Maximum Likelihood of phylogenetic trees

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

• sug: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

• sug: wise (>= 2.4.1-16)

  Vergleich biologischer Polymere, wie DNA- und Protein-Sequenzen

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
hppa (inoffizielle Portierung)	1.65+dfsg-1	1.151,5 kB	7.815,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.70+dfsg-2	1.137,3 kB	8.036,0 kB	[Liste der Dateien]