Paket: python3-biopython (1.84+dfsg-4 und andere)

[ Quellcode: python-biopython  ]

Python-3-Bibliothek für die Bioinformatik

Das Projekt Biopython ist eine internationale Vereinigung von Entwicklern frei verfügbarer Python-Werkzeuge für rechnergestützte Molekularbiologie.

Es ist eine verteilte, gemeinsame Anstrengung zur Entwicklung von Python-3-Bibliotheken und -Applikationen, die auf die Anforderungen der aktuellen und zukünftigen Arbeit in der Bioinformatik zugeschnitten sind. Der Quelltext ist unter der »Biopython License« verfügbar, welche sehr liberal ist und kompatibel mit fast jeder Lizenz auf der Welt. Das Projekt arbeitet zusammen mit der Open Bioinformatics Foundation, die für das Projekt Speicherplatz für CVS und für die Webseiten bereitstellt.

Andere Pakete mit Bezug zu python3-biopython

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.3.4) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.34) [armel, armhf, m68k]

  dep: libc6 (>= 2.4) [i386, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

• dep: python3 [nicht hppa]

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.13) [alpha, ppc64]

  dep: python3 (<< 3.14) [nicht alpha, hppa, ppc64, sparc64, x32]

  dep: python3 (<< 3.5) [hppa]

  dep: python3 (<< 3.7) [sparc64]

  dep: python3 (<< 3.9) [x32]

  dep: python3 (>= 3.12~) [nicht hppa, sparc64, x32]

  dep: python3 (>= 3.4~) [hppa]

  dep: python3 (>= 3.5~) [sparc64]

  dep: python3 (>= 3.8~) [x32]

• dep: python3-numpy (>= 1:1.10.0~b1) [sparc64]

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

  dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1) [x32]

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [nicht hppa, sparc64, x32]

  dep: python3-numpy (>= 1:1.8.0) [hppa]

• dep: python3-numpy-abi9

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch python3-numpy

• dep: python3-reportlab [hppa, sparc64, x32]

  Python3-Bibliothek zur Erzeugung von PDF-Dokumenten

  dep: python3-reportlab (>= 4.0.4-1~) [nicht hppa, sparc64, x32]

• dep: w3c-sgml-lib [nicht hppa, sparc64, x32]

  w3.org DTD and catalog files

• rec: ncbi-blast+ [nicht alpha, x32]

  next generation suite of BLAST sequence search tools

  rec: ncbi-blast+ (>= 2.10.0-3) [x32]

  rec: ncbi-blast+ (>= 2.10.1-3) [alpha]

• rec: python-biopython-doc (= 1.65+dfsg-1) [hppa]

  Dokumentation für die Biopython-Bibliothek

  rec: python-biopython-doc (= 1.70+dfsg-2) [sparc64]

  rec: python-biopython-doc (= 1.78+dfsg-2) [x32]

  rec: python-biopython-doc (= 1.83+dfsg1-4) [alpha]

  rec: python-biopython-doc (= 1.83+dfsg1-5) [ppc64]

  rec: python-biopython-doc (= 1.84+dfsg-4) [nicht alpha, hppa, ppc64, sparc64, x32]

• sug: bwa [nicht hppa, sparc64]

  Burrows-Wheeler Aligner

• sug: clustalo

  General-purpose multiple sequence alignment program for proteins

• sug: clustalw

  Globale multiple Alignments von Nukleotid- oder Peptidsequenzen

• sug: dialign

  Segmentbasiertes multiples Sequenzalignment

• sug: dssp

  protein secondary structure assignment based on 3D structure

• sug: emboss

  Europäische, quelloffene Software-Suite für Molekularbiologie

• sug: fasttree

  phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences

• sug: mafft

  Programm für multiples Alignment von Aminosäure- oder Nukleotidsequenzen

• sug: muscle [hppa, sparc64, x32]

  Multiple alignment program of protein sequences

• sug: muscle3 [nicht hppa, sparc64, x32]

  multiple alignment program of protein sequences

• sug: phylip [nicht hppa]

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: phyml

  Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood

• sug: prank

  Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences

• sug: probcons

  PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment

• sug: python-mysqldb [hppa, sparc64]

  Paket nicht verfügbar

• sug: python-reportlab [hppa, sparc64]

  Paket nicht verfügbar

• sug: python3-matplotlib

  Python-System ähnlich Matlab zur Ausgabe von Zeichnungen

• sug: python3-mmtf [nicht hppa, sparc64]

  binary encoding of biological structures (Python 3)

• sug: python3-mysqldb [nicht hppa, sparc64]

  Python-Schnittstelle zu MySQL

• sug: python3-pil

  Python3-Bildbearbeitungsbibliothek

• sug: python3-psycopg2

  Python-3-Modul für PostgreSQL

• sug: python3-rdflib [nicht hppa]

  Python-3-RDF-Bibliothek für Speicherung, Auswertung und Serialisierung

  sug: python3-rdflib (>= 4) [hppa]

• sug: python3-renderpm [hppa, sparc64, x32]

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch python3-reportlab

• sug: python3-scipy [nicht hppa]

  Wissenschaftliche Werkzeuge für Python 3

• sug: python3-tk

  Tkinter - Writing Tk applications with Python 3.x

• sug: raxml

  Randomized Axelerated Maximum Likelihood of phylogenetic trees

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

• sug: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

• sug: w3-dtd-mathml [x32]

  Mathematical Markup Language V2.0 DTD

• sug: wise [nicht hppa, sparc64]

  Vergleich biologischer Polymere, wie DNA- und Protein-Sequenzen

  sug: wise (>= 2.4.1-16) [hppa, sparc64]

python3-biopython herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.83+dfsg1-4	1.562,6 kB	11.838,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.84+dfsg-4+b1	1.612,3 kB	12.153,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.84+dfsg-4+b1	1.605,1 kB	13.175,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	1.84+dfsg-4+b1	1.596,9 kB	12.009,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.84+dfsg-4+b1	1.586,9 kB	11.785,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	1.65+dfsg-1	1.119,5 kB	7.788,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.84+dfsg-4+b1	1.609,0 kB	12.139,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	1.84+dfsg-4	1.586,6 kB	11.926,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.84+dfsg-4+b1	1.602,9 kB	13.197,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.83+dfsg1-5	1.582,7 kB	11.837,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.84+dfsg-4+b1	1.627,2 kB	13.175,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.84+dfsg-4+b1	1.610,7 kB	11.923,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.84+dfsg-4+b1	1.634,8 kB	12.163,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.84+dfsg-4+b1	1.623,4 kB	13.017,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.70+dfsg-2	1.139,3 kB	8.250,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.78+dfsg-2	1.365,8 kB	9.193,0 kB	[Liste der Dateien]