Paket: bali-phy (4.0-1 und andere)

[ Quellcode: bali-phy  ]

Bayesian Inference of Alignment and Phylogeny

BAli-Phy estimates multiple sequence alignments and evolutionary trees from unaligned DNA, amino acid, or codon sequences. BAli-Phy uses MCMC to estimate evolutionary trees, positive selection, and branch lengths while averaging over alternative alignments. BAli-Phy can display alignment ambiguity graphically in an alignment uncertainty (AU) plot.

BAli-Phy can also estimate phylogenies from a fixed alignment (like MrBayes and BEAST) using substitution models like GTR+gamma. BAli-Phy automatically estimates relative rates for each gene.

Andere Pakete mit Bezug zu bali-phy

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• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

  Dateisystemoperationen (portable Pfade, Iterationen über Verzeichnisse, usw.) in C++

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0) [hppa, m68k]

  Dateisystemoperationen (portable Pfade, Iterationen über Verzeichnisse, usw.) in C++

• dep: libboost-json1.83.0 (>= 1.83.0) [nicht hppa, ia64, m68k, x32]

  C++ containers and algorithms that implement JSON

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  C++-Bibliothek für Programmoptionen

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0) [nicht ia64, x32]

  C++-Bibliothek für Programmoptionen

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  Paket nicht verfügbar

• dep: libboost-random1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

  Boost Random Number Library

• dep: libboost-random1.83.0 (>= 1.83.0) [nicht ia64, x32]

  Boost Random Number Library

• dep: libc6 (>= 2.29) [x32]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
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  dep: libc6 (>= 2.38) [nicht alpha, ia64, loong64, x32]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libcairo2 (>= 1.4.10)

  2D-Vektorgrafikbibliothek Cairo

• dep: libfmt10 (>= 10.1.1+ds1) [nicht hppa, ia64, m68k, x32]

  Schnelle, typsichere C++-Formatierungsbibliothek -- Bibliothek

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  dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, sparc64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

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  GCC Support-Bibliothek

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• sug: seaview

  Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	4.0-1	9.258,5 kB	53.434,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	4.0-1	9.822,0 kB	52.710,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	4.0-1	8.730,3 kB	47.950,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	3.6.1+dfsg-3	6.226,6 kB	37.832,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	4.0-1	9.253,0 kB	51.011,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	3.6.1+dfsg-1	9.006,8 kB	69.870,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	4.0-1	9.159,7 kB	50.162,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	3.6.1+dfsg-3	5.450,2 kB	34.598,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	4.0-1	8.919,8 kB	58.594,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	4.0-1	9.151,4 kB	57.742,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	4.0-1	9.592,2 kB	56.065,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	4.0-1	10.112,1 kB	41.347,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	4.0-1	7.548,7 kB	48.143,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	4.0-1	8.190,5 kB	89.680,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	3.5.0.1+dfsg-1	5.788,7 kB	33.442,0 kB	[Liste der Dateien]