Пакет: bali-phy (3.6.1+dfsg-3 и други)

[ Източник: bali-phy  ]

Bayesian Inference of Alignment and Phylogeny

BAli-Phy estimates multiple sequence alignments and evolutionary trees from unaligned DNA, amino acid, or codon sequences. BAli-Phy uses MCMC to estimate evolutionary trees, positive selection, and branch lengths while averaging over alternative alignments. BAli-Phy can display alignment ambiguity graphically in an alignment uncertainty (AU) plot.

BAli-Phy can also estimate phylogenies from a fixed alignment (like MrBayes and BEAST) using substitution models like GTR+gamma. BAli-Phy automatically estimates relative rates for each gene.

Други пакети, свързани с bali-phy

• dep: libboost-chrono1.71.0 [x32]

  Пакетът не е наличен

• dep: libboost-chrono1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

  C++ representation of time duration, time point, and clocks

• dep: libboost-chrono1.83.0t64 (>= 1.83.0) [не ia64, x32]

  C++ representation of time duration, time point, and clocks

• dep: libboost-filesystem1.71.0 [x32]

  Пакетът не е наличен

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0) [не ia64, x32]

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-program-options1.71.0 [x32]

  Пакетът не е наличен

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

  program options library for C++

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0) [не ia64, x32]

  program options library for C++

• dep: libboost-random1.71.0 [x32]

  Пакетът не е наличен

• dep: libboost-random1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

  Boost Random Number Library

• dep: libboost-random1.83.0 (>= 1.83.0) [не ia64, x32]

  Boost Random Number Library

• dep: libc6 (>= 2.29) [x32]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, ia64, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libcairo2 (>= 1.4.10)

  Cairo 2D vector graphics library

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ppc64el, s390x]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, ppc64, sparc64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [не alpha, ia64, m68k, x32]

  dep: libstdc++6 (>= 14.2.0-2) [alpha]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [ia64, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: perl

  Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• rec: gnuplot

  Command-line driven interactive plotting program.
  също и виртуален пакет, предлаган от gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

• rec: r-base

  GNU R statistical computation and graphics system

• sug: figtree

  graphical phylogenetic tree viewer

• sug: seaview

  Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

Изтегляне на bali-phy

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	3.6.1+dfsg-3	6 361,3 кБ	40 360,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	3.6.1+dfsg-3	6 676,8 кБ	39 067,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	3.6.1+dfsg-3	6 024,2 кБ	36 555,0 кБ	[списък на файловете]
armel	3.6.1+dfsg-3	5 076,0 кБ	32 497,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	3.6.1+dfsg-3	4 629,1 кБ	23 653,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	3.6.1+dfsg-3	6 226,6 кБ	37 832,0 кБ	[списък на файловете]
i386	3.6.1+dfsg-3	6 350,6 кБ	37 805,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	3.6.1+dfsg-1	9 006,8 кБ	69 870,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	3.6.1+dfsg-3	5 450,2 кБ	34 598,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	3.6.1+dfsg-3	5 923,0 кБ	44 997,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	3.6.1+dfsg-3	6 105,6 кБ	44 043,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	3.6.1+dfsg-3	6 422,8 кБ	42 177,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	3.6.1+dfsg-3	6 670,8 кБ	31 791,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	3.6.1+dfsg-3	5 229,2 кБ	36 851,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	3.6.1+dfsg-3	5 204,0 кБ	63 539,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	3.5.0.1+dfsg-1	5 788,7 кБ	33 442,0 кБ	[списък на файловете]