Пакунок: bali-phy (3.6.1+dfsg-3 and others)

[ Source: bali-phy  ]

Bayesian Inference of Alignment and Phylogeny

BAli-Phy estimates multiple sequence alignments and evolutionary trees from unaligned DNA, amino acid, or codon sequences. BAli-Phy uses MCMC to estimate evolutionary trees, positive selection, and branch lengths while averaging over alternative alignments. BAli-Phy can display alignment ambiguity graphically in an alignment uncertainty (AU) plot.

BAli-Phy can also estimate phylogenies from a fixed alignment (like MrBayes and BEAST) using substitution models like GTR+gamma. BAli-Phy automatically estimates relative rates for each gene.

Інші пакунки пов'язані з bali-phy

• dep: libboost-chrono1.71.0 [x32]

  Пакунок недоступний

• dep: libboost-chrono1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

  C++ representation of time duration, time point, and clocks

• dep: libboost-chrono1.83.0t64 (>= 1.83.0) [not ia64, x32]

  C++ representation of time duration, time point, and clocks

• dep: libboost-filesystem1.71.0 [x32]

  Пакунок недоступний

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

  Операції з файловою системою (переносимі шляхи, операції з теками тощо) на Сі++

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0) [not ia64, x32]

  Операції з файловою системою (переносимі шляхи, операції з теками тощо) на Сі++

• dep: libboost-program-options1.71.0 [x32]

  Пакунок недоступний

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

  Бібліотека параметрів програми на Сі++

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0) [not ia64, x32]

  Бібліотека параметрів програми на Сі++

• dep: libboost-random1.71.0 [x32]

  Пакунок недоступний

• dep: libboost-random1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

  Boost Random Number Library

• dep: libboost-random1.83.0 (>= 1.83.0) [not ia64, x32]

  Boost Random Number Library

• dep: libc6 (>= 2.29) [x32]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [not alpha, ia64, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libcairo2 (>= 1.4.10)

  Cairo 2D — бібліотека векторної графіки

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ppc64el, s390x]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, ppc64, sparc64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [not alpha, ia64, m68k, x32]

  dep: libstdc++6 (>= 14.2.0-2) [alpha]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [ia64, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: perl

  Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• rec: gnuplot

  Command-line driven interactive plotting program.
  also a virtual package provided by gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

• rec: r-base

  GNU R — система для статистичних обчислень та представлення даних в графічному вигляді

• sug: figtree

  graphical phylogenetic tree viewer

• sug: seaview

  Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

Завантажити bali-phy

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	3.6.1+dfsg-3	6,361.3 kB	40,360.0 kB	[список файлів]
amd64	3.6.1+dfsg-3	6,676.8 kB	39,067.0 kB	[список файлів]
arm64	3.6.1+dfsg-3	6,024.2 kB	36,555.0 kB	[список файлів]
armel	3.6.1+dfsg-3	5,076.0 kB	32,497.0 kB	[список файлів]
armhf	3.6.1+dfsg-3	4,629.1 kB	23,653.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	3.6.1+dfsg-3	6,226.6 kB	37,832.0 kB	[список файлів]
i386	3.6.1+dfsg-3	6,350.6 kB	37,805.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	3.6.1+dfsg-1	9,006.8 kB	69,870.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	3.6.1+dfsg-3	5,450.2 kB	34,598.0 kB	[список файлів]
mips64el	3.6.1+dfsg-3	5,923.0 kB	44,997.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	3.6.1+dfsg-3	6,105.6 kB	44,043.0 kB	[список файлів]
ppc64el	3.6.1+dfsg-3	6,422.8 kB	42,177.0 kB	[список файлів]
riscv64	3.6.1+dfsg-3	6,670.8 kB	31,791.0 kB	[список файлів]
s390x	3.6.1+dfsg-3	5,229.2 kB	36,851.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	3.6.1+dfsg-3	5,204.0 kB	63,539.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	3.5.0.1+dfsg-1	5,788.7 kB	33,442.0 kB	[список файлів]