パッケージ: bali-phy (4.0-1 など)

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メンテナ:

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ホームページ [www.bali-phy.org]

類似のパッケージ:

Bayesian Inference of Alignment and Phylogeny

BAli-Phy estimates multiple sequence alignments and evolutionary trees from unaligned DNA, amino acid, or codon sequences. BAli-Phy uses MCMC to estimate evolutionary trees, positive selection, and branch lengths while averaging over alternative alignments. BAli-Phy can display alignment ambiguity graphically in an alignment uncertainty (AU) plot.

BAli-Phy can also estimate phylogenies from a fixed alignment (like MrBayes and BEAST) using substitution models like GTR+gamma. BAli-Phy automatically estimates relative rates for each gene.

その他の bali-phy 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libboost-chrono1.71.0 [x32]

パッケージは利用できません
dep: libboost-chrono1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

時間、時刻、クロックの C++ 表現
dep: libboost-chrono1.83.0t64 (>= 1.83.0) [ia64, x32 以外]

時間、時刻、クロックの C++ 表現
dep: libboost-filesystem1.71.0 [x32]

パッケージは利用できません
dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

C++ でのファイルシステム操作 (ポータブルなパス、ディレクトリの列挙など)
dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0) [hppa, m68k]

C++ でのファイルシステム操作 (ポータブルなパス、ディレクトリの列挙など)
dep: libboost-json1.83.0 (>= 1.83.0) [hppa, ia64, m68k, x32 以外]

C++ containers and algorithms that implement JSON
dep: libboost-program-options1.71.0 [x32]

パッケージは利用できません
dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

C++ 用プログラムオプションライブラリ
dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0) [ia64, x32 以外]

C++ 用プログラムオプションライブラリ
dep: libboost-random1.71.0 [x32]

パッケージは利用できません
dep: libboost-random1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

Boost 乱数ライブラリ
dep: libboost-random1.83.0 (>= 1.83.0) [ia64, x32 以外]

Boost 乱数ライブラリ
dep: libc6 (>= 2.29) [x32]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.38) [alpha, ia64, loong64, x32 以外]

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]
dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libcairo2 (>= 1.4.10)

Cairo 二次元ベクトルグラフィックライブラリ
dep: libfmt10 (>= 10.1.1+ds1) [hppa, ia64, m68k, x32 以外]

fast type-safe C++ formatting library -- library
dep: libgcc-s1 (>= 14.2.0-17) [loong64]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, sparc64, x32]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, ppc64, ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 共有ライブラリ
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 共有ライブラリ
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]

GNU 標準 C++ ライブラリ v3

dep: libstdc++6 (>= 14) [alpha, ia64, m68k, x32 以外]

dep: libstdc++6 (>= 14.2.0-18) [alpha]

dep: libstdc++6 (>= 9) [ia64, x32]
dep: libunwind8 [ia64]

プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版
dep: perl

Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

rec: gnuplot

Command-line driven interactive plotting program.
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
rec: r-base

GNU R 統計計算・グラフィックスシステム

sug: figtree

グラフィカルな系統樹ビューア
sug: seaview

Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

bali-phy のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	4.0-1	9,258.5 kB	53,434.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	4.0-1	9,822.0 kB	52,710.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	4.0-1	8,730.3 kB	47,950.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	3.6.1+dfsg-3	6,226.6 kB	37,832.0 kB	[ファイル一覧]
i386	4.0-1	9,253.0 kB	51,011.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	3.6.1+dfsg-1	9,006.8 kB	69,870.0 kB	[ファイル一覧]
loong64 (非公式の移植版)	4.0-1	9,159.7 kB	50,162.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	3.6.1+dfsg-3	5,450.2 kB	34,598.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	4.0-1	8,919.8 kB	58,594.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	4.0-1	9,151.4 kB	57,742.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	4.0-1	9,592.2 kB	56,065.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	4.0-1	10,112.1 kB	41,347.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	4.0-1	7,548.7 kB	48,143.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	4.0-1	8,190.5 kB	89,680.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	3.5.0.1+dfsg-1	5,788.7 kB	33,442.0 kB	[ファイル一覧]