Package: ggd-utils (1.0.0+ds-1 and others)

[ Source: ggd-utils  ]

Programmer til brug i ggd

Anvender en genomfil og (i øjeblikket) en .vcf.gz eller en .bed.gz og kontrollerer at:

 * en .tbi er til stede
 * VCF'en har ""##fileformat=VCF" som den første linje
 * VCF'en har et #CHROM-teksthoved
 * kromosomen er i rækkefølgen angivet af genomfilen (og til stede)
 * positionerne er sorteret
 * positionerne er <= kromosomlængderne defineret i genomfilen

Som resultat vil ethvert nyt genom, der går ind i GGD, have en .genom-fil, der dikterer sorteringsrækkefølgen og tilstedeværelse eller fravær af »chr«-præfikset for kromosomer.

Other Packages Related to ggd-utils

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

Download ggd-utils

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1.0.0+ds-1+b16	2,206.1 kB	6,605.0 kB	[list of files]
arm64	1.0.0+ds-1+b16	1,895.3 kB	6,162.0 kB	[list of files]
armel	1.0.0+ds-1+b16	1,964.1 kB	6,504.0 kB	[list of files]
armhf	1.0.0+ds-1+b16	1,958.5 kB	6,504.0 kB	[list of files]
i386	1.0.0+ds-1+b16	2,127.9 kB	6,428.0 kB	[list of files]
mips64el	1.0.0+ds-1+b16	1,791.9 kB	7,204.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.0.0+ds-1+b16	1,888.7 kB	6,417.0 kB	[list of files]
riscv64	1.0.0+ds-1+b11	1,962.8 kB	6,225.0 kB	[list of files]
s390x	1.0.0+ds-1+b16	2,005.8 kB	6,865.0 kB	[list of files]