Пакет: ggd-utils (0.0.7+ds-3 и други)

[ Източник: ggd-utils  ]

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Други пакети, свързани с ggd-utils

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.3.6-6~) [i386]

  dep: libc6 (>= 2.4) [не arm64, i386, ppc64el]

Изтегляне на ggd-utils

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	0.0.7+ds-3+b6	1 685,4 кБ	5 273,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	0.0.7+ds-3+b6	1 441,3 кБ	4 860,0 кБ	[списък на файловете]
armel	0.0.7+ds-3+b6	1 470,3 кБ	4 508,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	0.0.7+ds-3+b6	1 465,2 кБ	4 444,0 кБ	[списък на файловете]
i386	0.0.7+ds-3+b6	1 601,7 кБ	4 482,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	0.0.7+ds-3+b6	1 362,7 кБ	5 335,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	0.0.7+ds-3+b6	1 385,8 кБ	4 987,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	0.0.7+ds-3+b6	1 415,6 кБ	4 924,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	0.0.7+ds-3+b6	1 545,2 кБ	5 183,0 кБ	[списък на файловете]